分子蒸餾是一種特殊的液--液分離技術，它不同于傳統蒸餾依靠沸點差分離原理，而是靠不同物質分子運動平均自由程的差別實現分離。
實驗室短程蒸餾是熱敏產品在真空條件下的熱分離過程,是一種短距離運行的蒸餾技術。它是一種基于負壓下液體混合物中的沸點差異來分離混合物的方法。當待凈化樣品混合物在加熱時，蒸汽揮發上升進入立式冷凝器，隨之被冷媒冷卻。玻璃型分子蒸餾設備，專門用于前期的工藝開發及實驗，透明的玻璃，能夠很好的觀察物料在分離過程的現象，及時進行工藝的優化調整。
條件：
1、殘余氣體的分壓必須很低，使殘余氣體的平均自由程長度是蒸餾器和冷凝器表面之間距離的倍數。
2、在飽和壓力下，蒸汽分子的平均自由程長度必須與蒸發器和冷凝器表面之間距離具有相同的數量級。在這此理想的條件下，蒸發在沒有任何障礙的情況下從殘余氣體分子中發生。所有蒸汽分子在沒有遇到其它分子和返回到液體過程中到達冷凝器表面。蒸發速度在所處的溫度下達到可能的最大值。蒸發速度與壓力成正比，因而，分子蒸餾的餾出液量相對比較小。
在大中型短程蒸餾中，冷凝器和加熱表面之間的距離約為20~50mm，殘余氣體的壓力為10-3mbar時，殘余氣體分子的平均自由程長度約為2倍長。短程蒸餾器能滿足分子蒸餾的所有必要條件。
